Press "Enter" to skip to content

Make the Pill Fit the Ill | Sofia Tomov | TEDxUTK


скажем, вы смотрите Суперкубок и
вы видите рекламу лекарственного средства, отпускаемого по рецепту
мы все видели их начинающие краски
оптимистичная картина наркотиков
последовали невероятные возможности лечения
по длинному списку побочных эффектов
от головокружения до смерти, когда
кто-то принимает лекарство по рецепту
они также берут потенциально смертельный
игра с более чем 70% американцев на
по меньшей мере одна переменная рецепта
ответы на лекарства являются огромными
проблемы неблагоприятных лекарств
ответственный за приблизительно 50% всех
годовая больница всех ежегодная
госпитализации и являются четвертыми
главная причина смерти в нас
неблагоприятные наркотические события несут ответственность за
около 1,5 млн. годовых
госпитализации — 3%
ежегодные госпитализации означают, что
каждую минуту три человека
госпитализирован с неблагоприятным лекарством
реакции, почему лекарство может вылечить
человек, но ядовитый другой, я решил
преследовать проект в области биоинформатики
науки о анализе генетических данных
изучить этот вопрос, который я выдвинул
что ответ человека на наркотик
под влиянием их генома или всего их
ДНК для разработки моей идеи
Я думал о ДНК и о том, как работают наркотики
что генетика имеет отношение к
наркотики сразу же
пищеварительная система разрушает препарат в
молекулы, которые протекают через
кровь реагирует на препарат
когда молекулы лекарства связываются с телом
молекулы и вызвать определенный ответ
эта процедура ответа известна как
сигнальный путь клетки собственной сигнализации
пути как блокирующие ключевые механизмы
где часть молекулы лекарственного средства
ключ , который входит в состав тела
молекула, когда молекулы связывают друг с другом
они открывают дверь к физическому
ответ на лекарство, посылая сигнал
к телу химические вещества в организме, называемые
ферменты ускоряют реакции между
молекулы лекарства и молекулы тела и
может влиять на сигнализацию соты
ДНК пути содержит инструкции
для тела для ферментов ферментов
сделаны из белков и вашего уникального набора
белков — это то, что делает вас
мутации или изменения в коде ДНК
может изменить, какие белки и ферменты
следовательно, изменение
фермент может изменить сигнал о том, что
лекарство отправляется в организм, поэтому, возможно, ферменты
это было связано с мутациями
для побочных эффектов, когда я читаю о
Последовательность генома Я думал, ничего себе, если
есть способ анализа генома на
найти мутацию, тогда может быть
способ сопоставить эти мутации в сторону
Я исследовал мутации в
ферменты, критические для поглощения
препараты липитор plavix и тегретол I
сосредоточены на этих препаратах, поскольку они
хорошо изучены с использованием общедоступных баз данных
Я обнаружил мутации, связанные с
эффективности и побочных эффектов, таких как
чрезмерное кровотечение для липитора plavix
и тегретол
однако знание мутации только решает
половина проблемы ДНК-кода состоит из
строительные блоки, известные как основы этих
основания подобны алфавиту ДНК
код для белков, чтобы знать, есть ли
аномальная мутация в этом коде ДНК
врачи должны искать весь геном
это шесть миллиардов баз, когда я увидел
этот вызов я добавил к своей гипотезе
и предсказал , что я мог бы новшества
компьютерный алгоритм или решение проблемы
процедуры для поиска мутации
вызвала мою следующую идею, я мог бы
строка алгоритма поиска строк
алгоритмы поиска — компьютерные
программы, которые находят строку букв
в тексте геном представляет собой текст и
мутация — это строка, как строка
алгоритмы поиска спасти жизни этих
алгоритмы могут найти мутации, позволяющие
врачам искать базу данных для
мутации сравнивают их с известными
вызвать побочные эффекты и назначить
возможно, спасательный препарат моей инновации
является алгоритмом поиска строк, который
обнаруживает мутации, связанные с ответами на наркотики
это может помочь решить проблему
переменные ответы на отпускаемые по рецепту лекарства
Я создаю критерии дизайна для моего
инновации он должен быть функциональным
возможно и быстро, почему существует необходимость
для скорости быстрый алгоритм может быть
спасение жизни в чрезвычайных ситуациях, таких как
как приступ или аллергический шок, когда
необходимо назначить правильный препарат
немедленно для удовлетворения этой потребности я
проверили несколько алгоритмов и сузили
это до апостиля Эко Джанкарло
и поиск обратных факторов
алгоритмов в общей работе, чтобы найти
шаблон P в текстовой команде апостиль
eco Giancarlo использует эффективные
алгоритм для хранения символов и поиска
сопрягать вместо сравнения каждого
символа в шаблоне P с каждым
символа в тексте T,
многопользовательские операции apostille eco
Джанкарло может пропустить несогласованные выравнивания
когда совпадение не найдено обратного фактора
быстрее, поскольку использует аналогичные
метод для апостиля Эко Джанкарло
но сохраняет данные более эффективно, поэтому
тип массива, который позволяет компьютеру
для быстрого доступа к значениям данных из
однако я знал, что существующие
алгоритмы не могли быстро найти мутацию
достаточно, чтобы я обновил параллельные версии
из них параллельная программа может работать
несколько компьютерных процессоров
параллелизм делает алгоритм быстрее a
параллельная программа может работать на нескольких
компьютерные процессоры параллельные вычисления
как ткачество коврика, где ковер
задача или поиска генома и
рабочие — это переработчики, если один рабочий
делает работу он может считать , что работник
месяц, но если десять работников выполняют работу
ковер займет всего несколько дней, чтобы закончить
в двух словах параллелизм делает
процессоры работают вместе, уменьшая
я обнаружил, что парализуя
алгоритмы с четырьмя процессорами
ускоряется каждый последовательный на 400%
параллельный обратный коэффициент был вдвое больше
скорость параллельного апостиля eco
Джанкарло ускоряет оригинал
алгоритм на 8
хотя я получил свои результаты в
миллисекунд с 800 000 байт
выдержка из хромосомы 1 каждый алгоритм
потребовалось бы несколько часов для работы с использованием целого
генома человеческого генома составляет 6 миллиардов
оснований, которые делают алгоритм
7,500 раз дольше, чем в моем
эксперименты
врачи запустить алгоритм поиска
для множественных мутаций в целом
геном, который может занять несколько часов
это может быть слишком поздно для пациентов в
чрезвычайные ситуации, поэтому
ускоренный алгоритм, такой как мой, будет
помочь спасти жизнь , разрешив врачам
быстро предсказать реакцию пациента на
Я стал финалистом в
открытие 3 млн. молодых ученых вызов
для этого исследования я смог развить
мое нововведение через лето
наставничество с 3-м ученым Джоном
Лидер отрасли и лекарств Henderson
программное обеспечение для управления рисками табула
rasa healthcare пригласила меня представить
их штаб, хотя мой алгоритм
была эффективной, я думал, что смогу улучшить
осуществимость, поскольку процедура
больницы для доступа к геномам все еще не
в настоящее время хорошие новости
секвенирование генома становится все более
широкое распространение и было дорого , чтобы получить
некоторые больницы уже выполняют последовательность
каждый генофонд новорожденных, демонстрирующий
повышение возможности персонализации
однако доступ к геномам и
перевод сложных медицинских тестов в
единственный рецепт остается проблемой
Я создал прототип графического
пользовательский интерфейс, который показывает, как я представляю себе
используя мое новшество, чтобы помочь врачам
доступ к геномам
это показывает, как я предполагаю использовать мой
алгоритм параллельного обратного фактора и
программное обеспечение для управления рисками
помоги спасти жизнь сейчас я собираюсь показать
мой прототип моего прототипа
позволит врачам получать доступ к геномам
найти мутации, а затем связать их с
лекарственные реакции представляют пациента
обрушивается с захватом больного
немедленно получает лекарство от врача
входит в диагноз кандидата пациента
наркотиков и генома последовательности врача
затем запускает мой параллельный обратный коэффициент
алгоритм для получения информации о
потенциальный рецепт во время
этот восьмиминутный разговор двадцать четыре
люди были госпитализированы с неблагоприятным
наркомании мое нововведение имеет
потенциал для сокращения этих
госпитализации и улучшения здоровья
продвижение поля персонализированного
Медицина Я представляю будущее, где
лечение с учетом СВОИМИ
индивидуальный геном , где кто — то может принять
наркотики, а не просто надежды на ожидание
положительный результат биоинформатики
исследование, подобное моему, может скоро
превратить это видение в реальность
позволяя врачам принимать таблетки
больной спасибо
[Аплодисменты]
Please follow and like us:

Be First to Comment

Добавить комментарий