Press "Enter" to skip to content

How Sharing Big Data is Changing the World | Adam Summers | TEDxSanJuanIsland


[Музыка]
привет большое спасибо за то , что я собираюсь
немного рассказать об одной вещи
это следующее для науки, и я собираюсь
используйте пример из моего собственного исследования, но
я говорю о широком
применительно к науке большой
поговорим с вами о очень больших данных
это были бесплатные данные для всего моего
карьера была большой , я всегда был полным
теперь дискеты теперь накладываются рейдами, когда я
началось их 92 килобайта, а я
заполнили их тогда сотнями мегабайт
то 10 гигабайт и теперь огромные суммы
так как физиологи рассматривали данные в
килобайты могут быть мегабайтами
геномики данных, которая сделала
невероятная работа как большой, так и
совместного использования и открытых работ в
мегабайты думают о диапазоне байтов, я
интересуюсь формой, которую меня интересует
форма скелетов и мягких
ткани, которая их окружает, и тех
данные огромны, поэтому они запускаются из
гигабайт до терабайт
для одиночных наборов данных и даты всегда
была большой по сравнению с нашими возможностями
но до очень недавних
не бесплатно данные были заперты в немного
силосы в лабораториях ученых
где вы не могли добраться до них, где я
не могли добраться до них, где их
коллеги не могли добраться до них, где
их супруги и дети не могли
у них никто не мог получить эти данные
иногда десять лет спустя они не могли
пойди, я собираюсь поговорить с тобой о
большие морфологические данные задают набор данных
Я собираюсь рассказать о вычислении
томография сканирует компьютерную томографию
скажите, что такое компьютерная томография,
требует какой-то сказочный кукольный палец
вот фотореалистический вид птицы только
на экране, и вы видите птицу и
это загадочно для вас, потому что вы
не видел, чтобы я вошел с птицей, но
теперь есть один, но если я замерз руку
на месте теперь смотрят только на экран и
поверните его на сто восемьдесят
градусы, наблюдающие только те тени в
ваш мозг теперь может не только увидеть, что
это не птица, которую вы можете
пальцы в том же положении, что и мой
пальцы были в вас, можно обезвредить эти
тени в 3d-форму моей руки CT
сканирование точно , что только вместо
света он использует рентгеновские лучи, поэтому вместо
черно- белая тень есть
оттенок серого с самыми темными битами
будучи самым радио-непрозрачным, и
наименьшие биты
рентгеноконтрастный
поэтому компьютерная томография генерирует 3D-объем
плотность
конечный результат выглядит так, как
пиранья красивая рыба, которую я отсканировал
потому что я хотел увидеть его зубы, которые
это деловая сторона дела
это то, что все хотят видеть
но в тот момент, когда я посмотрел на это сканирование, я
понял, что я знал что-то о том, как это
живет на стороне, где вы можете
см. два ребра, которые были разделены пополам
потому что это школьная рыба, которая
действительно хорошо вооружены, и когда они
их небольшие дискуссии среди каждого
другие они приводят к серьезным ранам, поэтому
эти модели скелетов могут сказать нам
как рыба живет, и меня интересует КТ
сканирование всех рыб не каждый
человек, но каждый вид его 33 000
видов рыб и при обычных КТ
скорости сканирования мы говорим о 45
летний проект, так что когда я ударил
средний возраст я должен сделать, я планирую
занимают упражнения между сейчас и потом
убийца — это
от 3 до 300 миллионов долларов и
так как я очень люблю рыбу, и я действительно
я имею в виду, что я глубоко очарован
их я не мог оправдать
виды средств на сканирующую рыбу
скелеты, поэтому у нас есть выбор, который мы можем
либо сканировать меньшее количество видов, либо мы можем сканировать
быстрее , и я принципиально не
меньше людей
поэтому мы подняли некоторые филантропические фонды
на самом деле очень большой набор пожертвований
позволило нам купить микроскороскоп
который живет прямо по коридору в моем
офиса и от этого сканера I
обнаружил две истины , что должно
были очевидными истинами, но которые мне
в то время
мы не очевидно , вообще первым
это то, что все КТ-сканирование
опросить s — цилиндрический объем, как
многие люди здесь действительно были в
Сканер КТ просто дает рейз van oh wow
огромные цифры, которые потрясающе, так что вы
лежал там, где ты лежал в постели и
либо кровать попадает в пончик, либо
в некоторых моделях пончик спускается вниз
кровать, которая создает красивую
трехмерное изображение нарушителя
часть вашего тела, что вы, возможно, не знаете
что все внутри пончика
все было проверено вами и вашим
обижая часть кровати воздух вокруг
все это было отсканировано, но мы знаем, что
воздух выглядит, и мы знаем, какие кровати
выглядят так, что это было ужасно
неэффективно мы действительно должны были свалить
по крайней мере, полдюжины человек
когда вы проводите их через него один раз
потому что все отсканировано
так что это была первая реализация
вторая реализация была более тонкой и
это правда, что вы
не хотят все разрешения в любое время
вы делаете снимок, есть определенный
размер для этих пикселей в CT
аналогия — вокселы , объем
элементы, и все вы знаете, когда вы
получить новую камеру, что люди просят вас
о, сколько мегапикселей — все в порядке
вот что они задают первый вопрос
они не спрашивают, сколько это было сделано
вам нравится, что вы берете ледник
Вы знаете , сколько мегапикселя есть
другое разрешение, если вы владеете КТ
сканер , это первое, что есть
какова резолюция, во- вторых, они
спросите, насколько велика вещь, которую я могу положить
там, как будто бы существовала какая-то вселенная
где они хотели бы получить пять
тысяч ломтиков на миллиметр
весь мертвый бегемот, который был бы
больше данных, чем на всех жестких дисках
в Соединенных Штатах прямо сейчас вы не
хочу, чтобы все резолюции так, сколько
вы хотите, я имею в виду, что это хороший вопрос
тот, о котором мы говорили, чтобы ответить нам
посмотрел на множество исследований, и мы обнаружили
что это полностью зависит от того, что вы
делая с ним и так, что мы должны были сделать
выяснилось, что в худшем случае
какое у вас наибольшее разрешение
может потребоваться, и оказывается, что
большинство резолюций вы хотите для практического
целей составляет около двухсот пятидесяти
ломтики по голове, дай мне рыбу
Я могу измерить ширину его головы и
Я могу сказать, какое разрешение вы хотите
для сканирования, что означает, что я могу предварительно
печатные цилиндры, которые я могу упаковать вместе с
рыба с цилиндра справа от вас — 30
микронный цилиндр 33 ломтика на миллиметр
слева от вас цилиндр, который больше
это цилиндр размером 50 микрон, он дает вам
20 ломтиков на миллиметр, и я могу просто
упаковать рыбу там, это не сработает
с людьми в здравоохранении это
инновации, которые я предложил, но это
что объект люди мертвые рыбы не
это одна из основных причин, по которым я работаю
с ними
разрешение, на которое вы нацелены, зависит от
размер рыбы, что означает, когда вы приносите
сотни рыб в мою лабораторию, чтобы отсканировать их
первое, что у меня есть, — это устроить
их по размеру мы выбираем
образцы, которые будут отсканированы
при определенном разрешении, и мы начинаем
при загрузке цилиндра мы можем поместить 10
20 образцов в этом цилиндре и когда
мы сканируем его, мы получаем это
мы переосмыслили этот
в середине недели рыбный буррито, который
где-то около 20 отдельных видов
в группе скальпин, отсканированных
аспирант по имени Фаддей бух сэр
Таддеус пришел в лабораторию, и мы и
разработал этот метод, это
очень первый рыбный буррито, который когда-либо был
Я знаю это, потому что это
отсутствует ключевое новшество, которое появилось
со вторым рыбным буррито, которое было
когда-либо отсканированные маленькие радио-непрозрачные ярлыки
так что мы могли бы сказать одну рыбу из
другой, потому что оказывается, что только
самый толстый мог сделать следующий трюк, используя
свободное программное обеспечение , то вы можете рассекать один
рыба из буррито репозиционирует его в
какой-то анатомически полезный способ сделать это
снова и снова , и в течение 1/2 часа CT
сканировать то, что когда-то было полным доктором философии
диссертация — теперь очистка горла
для главы 1 мы можем сканировать более 700
видов в месяц с одним сканером
не только то, что сканеры здесь
действительно тяжелый, и я никого не пускаю
взять его куда угодно, но данные могут быть
обработано за пределами площадки
лучше всего данные могут быть обработаны
с бесплатным программным обеспечением с открытым исходным кодом, которое
доступно на каждой платформе Linux Mac PC
что бы вы ни хотели, мы говорим о
очень большие данные за 2000 видов
более 4000 образцов сканирования в последнем
год, потому что иногда вы хотите знать
что происходит со скелетом как
что-то растет, поэтому вы просматриваете 20 из
то же самое мы сканировали более 300
семьи рыб и по состоянию на вчерашний день
мы сидим на 50 6 терабайтами
информация Я не могу рассказать вам, как несчастный
Я бы хотел, чтобы эти данные были чем-то
Я должен был охватить то, что мне пришлось
окружают и защищают от посторонних глаз в
Лучше всего об этих данных: они
полностью открытый доступ, который можно получить
доступ ко всем этим данным и анализ
он со свободным программным обеспечением любого в
мире в любой точке мира это
полностью демократизирует процесс
касающихся этих действительно важных
морфологические данные, поэтому мы
доступную доступность для получения большого количества
люди получают доступ и учатся намного больше, чем
мы когда-либо могли бы положить это на
действительно опрятный веб-сайт Morpho
источник, чтобы вы могли пойти сюда и скачать
любой из наборов данных, и мы уже
видя преимущества, которые я получил
апологетическая электронная почта от замечательного немецкого
нейробиолог Майкл Хоффман, который
которому он был ужасно смущен, чтобы сказать
мне, что он загрузил все мои данные
и потому что он мастер сети и отличный
при изготовлении поверхностей он принял все
мои данные и принимать эти кусочки и
превратили их в 3D для печати с возможностью вращения
модели
и он выставил их на веб-сайт для
любой, кого можно скачать для любых целей и
ему было очень жаль, потому что он не был уверен
Я получал достаточно кредитов для этого
пожалуйста, сделайте более ужасные вещи, подобные этому
для меня это потрясающе, так что теперь вы можете пойти
к этому виртуальному Музею Естественного
История и Майкл наделили мое имя
смущающе на первой странице, говоря
вы знаете, вот куча рыбы Адама
они не моя рыба, они все
ловить доступность этих данных
позволил команде компьютерных наук
заинтересованы в концепции извлечения
объект из поля данных, который был
совершенно неизвестный, он вдохновил их
попробуйте свои инструменты на моих рыбных буррито и
поэтому они произвели эту вещь, названную topo
рыболовом, и они взяли на себя работу,
делать вручную в течение шести или
семь часов и бросил его до
15-минутная задача, поскольку данные были
там они могли бы иметь это для любых целей
они хотели так, что дальше для науки
что дальше — гораздо больше сотрудничества
намного больше обмена данными более открытыми
доступ к данным более открытый доступ публикации
научных результатов, чтобы вы не
сидя там, читая некоторые, я имею в виду
страшное оправдание новостям науки
следуйте ссылке и добирайтесь до научной
бумаги и наиболее
наличие этих огромных наборов данных для
все приглашают синергию по всем полям
физики химики компьютерные ученые
и биологи все понимают, что мы
работают над очень похожими проблемами и часто
нужны очень похожие инструменты, поэтому эти трехмерные данные
которые вы знаете для меня
полезны как вдохновение для новых
инженерных и новых технологий и
биоматериалы для других людей могут быть
полезно для чего-то полностью
разные по своей наивысшей цели
конечно, не те идеи, которые у меня есть
поскольку я собираю эти данные
целей, и давая
доступ людей мы гарантируем , что
возможность их выполнения
там так что дальше больше доступа больше
сотрудничество спасибо
[Аплодисменты]
Please follow and like us:

Be First to Comment

Добавить комментарий