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Precisely practicing medicine with a trillion points of data. | Atul Butte | TEDxSanFrancisco


Ero solito ridere di quelle persone
ridi ancora a quella gente
conosci il tipo che intendo usare come gadget
questo con la misurazione di ings e fitbit
tutto ciò che è entrato e uscito da loro
corpi nel 2011 questo campo è stato chiamato
il sé quantificato è davvero decollato e io
era solito ridere davvero di queste persone
fino al 2012 quando ho messo piede su una scala e
Ho pesato 247 sterline ho pensato a me stesso
quando raggiungo il 250, possono misurarmi
questo è un ottavo di tonnellate
letteralmente quello che sembro
durante il mio TEDMED del 2012 ho parlato con alcune persone
sono in imbarazzo a vedere il loro video che
era davvero imbarazzato vedere questo video
Ho pensato a me stesso cosa mi è successo
Sto guidando ovunque nella Silicon Valley
Ho camminato molto e ho comprato tutto
Fitbit cuoce ho iniziato a seguire i miei passi
come molti di voi fanno ora ma in realtà
più interessante inizio a pesarmi
ogni giorno e registro tutto ciò che mangio
Ho registrato ogni pasto ogni giorno per
negli ultimi cinque anni ho perso 50 sterline e
due anni e mezzo
questo è un giorno la perdita di peso guidata e
io come scienziato dei dati questo era un
esperienza incredibile ho imparato molto io
appreso che in realtà non importa
sulla qualità delle voci di cibo
fai sì che conosca i bei giorni in cui conosco il
brutti giorni ma in modo preciso ora
sapere quali sono gli alimenti che aggiungono eccesso
calorie al mio giro non lo fa
importa se il dato è imprecisa la
l’apprendimento è preciso ora non sto dando un
testimonial di prodotto per Fitbit no
tutti ottengono gli stessi risultati che sono un
early adopter per molti di questi gadget
Adoro gli aspetti sociali tutti i miei
amici su Fitbit su Facebook conoscono
il mio Fitbit ho perso 50 chili ma ecco
il punto interessante che ho fatto di più
importante intervento sanitario della mia vita ma
Io quando andai ad andare a vedere le mie cure primarie
medico presso un importante sistema medico vicino
qui e hanno speso un miliardo di dollari
installazione di una cartella clinica elettronica
sistema il mio medico di base era il
l’ultimo a sapere che ho perso 50 sterline
perché il loro sistema da miliardi di dollari
non parla con il mio gadget $ 40 e quello
deve cambiare dobbiamo fare che
cambiare e come quella medicina sta andando
cambiare da questa era passata di hands-on
pratica in una nuova era di data driven
medicina ora dati e computazione hanno
cambiato molti campi negli ultimi pochi
decenni era solo una questione di tempo
prima che questo accadesse alla medicina e
i dati di per sé non fanno nulla come
un paziente voglio condividere i miei dati ora
con quelli che si preoccupano di me e di quelli
mi importa di me ma questo è un
partnership ora il medico del
presente o il medico del futuro
deve accettare tali dati e rimandarli indietro
consigli e raccomandazioni che non lo fanno
capita oggi quindi non lamentiamoci del
In effetti, i dati stanno guidando la medicina
il futuro lo celebriamo e andiamo
usalo
e prendiamo più pazienti e
fornitori di servizi sanitari che utilizzano i dati
è là fuori che abbiamo così tanti dati in
medicina oggi quantità incredibile di
dati su cui abbiamo dati su dati individuali
dati dei pazienti sui medici abbiamo dati
sulla qualità e composizione della quantità
delle cure che stiamo consegnando o della mancanza
di qualità nella cura che siamo
offrendo abbiamo dati sulla performance
di medici e infermieri su cui abbiamo Dan
il prezzo dei dispositivi medici e
prodotti farmaceutici stiamo entrando in un’era di
grandi dati in biomedicina alcuni dei
i maggiori dati provengono effettivamente dal
sistemi sanitari e medici e
i dati che generano con te
per esempio i dati molecolari che stiamo ottenendo
sempre più le misure di molecole
dove le proteine ​​o il DNA di te o
un giorno i tuoi tessuti o i tuoi tumori
la sinistra è il Whitehead Institute a
foto di quello Whitehead Institute
dei centri che hanno generato un bene
pezzo del progetto del genoma terminato
nel 2003 dopo 13 anni e 3 miliardi
dollari di impegno e a destra è mio
mano che regge uno stick sequencer USB uno
di questi funziona davvero nello spazio
stazione ora è un gioco da ragazzi
diventeremo sempre più molecolari
dati dai pazienti in futuro
ci sono dati di imaging se si tratta di raggi X.
di casse o polmoni o ossa o scansioni CT
o MRI questi sono file enormi che vanno
da 3 megabyte a 3 gigabyte
a seconda del tipo di studio che il tuo
il medico potrebbe ordinare e poi c’è
reclami dati
qual è un reclamo un reclamo è come noi e
la medicina invia una fattura per essere pagati qui
un esempio di un reclamo scritto a mano
possono trovare su Internet
ora sono elettronici, naturalmente
una cima vedi alcune informazioni su a
paziente il loro indirizzo la loro età e poi
vedi i codici ai codici in basso
cosa facciamo con questi pazienti e
quali disturbi o condizioni pensiamo
il paziente ha questi sono come noi e
la medicina viene pagata quando vediamo un paziente
un reclamo può andare solo finora
rappresentare un paziente anche se questi
sono elettronici e li abbiamo avuti per
decenni puoi già vedere come limitante
possono essere i dati finali da avere
sono le vostre cartelle cliniche Lasciate che vi faccia
un’analogia della differenza tra
reclami e cartelle cliniche diciamo che io
ti ha detto che ho veramente amato di andare a
questo ristorante chiamato mattoni a Napa
Valley forse qualcuno di voi è stato lì
e sei curioso perché amo questo
il ristorante così tanto aiuta davvero
tu per vedere il conto puoi vedere io
spendere una discreta quantità di denaro lì
forse ho avuto una bella festa lì ma
non preferiresti vedere ciò che abbiamo ordinato
al ristorante puoi vedere che abbiamo ordinato
le torte di granchio che puoi vedere abbiamo ordinato a
Balducci Pinot Noir quale di questi avrebbe
devi piuttosto capire in realtà
cosa stiamo facendo ciò che era nostro
esperienza al ristorante e questo è
la differenza tra le affermazioni mediche
e le cartelle cliniche delle cartelle cliniche sono
il record finale di ciò che è in realtà
succede ad un paziente che cos’è esattamente un
cartella medica ci viene chiesto di pensare
di questi tutto il tempo
quando firmiamo le forme ciò che è in un medico
disco
ben note mediche risalgono al 1907
sono stati inventati alla Mayo Clinic quindi
sono passati centodieci anni
abbiamo avuto cartelle cliniche basate su carta
e quando pensiamo alle cartelle cliniche noi
pensa a scaffali come questi che ricordi
vedendoli magari quando stavi crescendo
su
questi sono documenti cartacei in un
ambulatorio ben organizzato con
adesivi e note scritte a mano all’interno
ma questi sono per i pazienti ambulatoriali al minuto
tu verrai davvero in un ospedale tuo
diventano record medici diventano
enorme e sono memorizzati in leganti
come questi e questi legatori erano
rigorosamente definiti inizieranno con il
ordini di farmaci rispetto alla nota di ammissione
e le note di progresso viziate seguirono
dai fogli di flusso e dalle note infermieristiche
e poi i risultati dei test di laboratorio e
radiologia e patologia e poi
da qualche parte nella parte posteriore c’erano i social
note di lavoro è quasi come se avessimo un
gerarchia in medicina
implementato fisicamente attraverso il
naufragio medico
puoi solo mettere le tue note nel giusto
posto ora ovviamente oggi questi sono tutti
elettronica ma allora questi erano
enormi record nel neonato
unità di terapia intensiva a cui eravamo abituati
festeggiamo quando i nostri piccoli bambini pazienti
probabilmente pesava più del loro medico
registri ma ora ovviamente lo sono
elettronica e l’unico modo di elettroni
il modo in cui gli elettroni costano miliardi
di dollari sei tre esempi Sutter
speso 1 miliardo di dollari sul loro
partner del sistema di cartelle cliniche elettroniche
oltre a Boston ha speso 1,2 miliardi di dollari
e Kaiser ha speso 4 miliardi di dollari
le loro cartelle cliniche elettroniche solo a
un po ‘più di $ 0,99
ti stai chiedendo se acquistare
in App Store per un’app ora è così
tipo di divertente se guardi questi
titola i miliardi di dollari di Sutter
speso è scritto come un boondoggle ma
il quattro miliardi di dollari che Kaiser ha speso è
scritto come vincere una scommessa e loro
comprato lo stesso software a cui paga
avere gli amici giusti come reporter e
questi sistemi di registrazione elettronica sono
ci costa miliardi invece di
sezioni del record che ora abbiamo
tavoli fino a 18.000 tavoli che compongono il
database che alimentano l’elettronica
sistemi di record di salute abbiamo tabelle
che registra ogni incontro in paziente
ora paziente ogni farmaco ordinato e
dispensato IV segno vitale ogni test di laboratorio
risultato e, naturalmente, le note di tutti
quei milioni e milioni di testo
prende nota di ogni nota di ammissione
progresso nota ogni nota di scarico ogni
la telefonata viene documentata in tutto
queste note enormi quantità di dati ancora
nonostante tutti questi dati siamo ancora
a volte manca il più ovviamente
dati rilevanti che ti posso dare
un esempio se un grande ospedale della città invia
a casa dopo aver intervento chirurgico importante per
prenditi cura con le tue cure primarie regolari
medico
il grande ospedale della città non potrebbe mai
in realtà so cosa ti è successo dopo
quella chirurgia che si chiama il tuo risultato
i tuoi risultati l’unica forma grezza di
esiti che l’ ospedale della grande città potrebbe
è chiamato il tuo scarico
disposizione
sai quale sia la disposizione di dimissione
sei morto o te ne sei andato e se tu
a sinistra sei andato a casa sei andato a
ospizio o sei andato in un altro
disposizione di dimissione ospedaliera è come
quella altra canzone degli Oak Ridge Boys che tu non hai
devo andare a casa ma non puoi restare qui
quindi immagina la prossima cosa che
succede a te se hai fatto meglio o
peggio è bloccato nel maggiore di qualcun altro
sistema informatico pensiamo a come
ridicolo che è per un momento, facciamolo
immagina che stai imparando a suonare a
gioco chiamato scacchi o insegnare un computer
come si gioca a scacchi non penseresti il
il computer vorrà sapere quali mosse
ciò ha portato a un gioco vincente oa un
perdere la partita ora immagina di provare ad imparare
come si gioca a scacchi e si ottiene solo il
prima metà del gioco o immagina di provarci
imparare a giocare a scacchi e tu vuoi
prendi l’ultima metà del gioco, non è vero?
evidente
quanto limitante è se questi sistemi
non possiamo parlare tra di noi che dobbiamo fare
meglio di questo
dobbiamo creare nuovi metodi e altro ancora
modelli di business poco nuovi per ottenere salute
sistemi per iniziare a condividere questi dati con
l’un l’altro lo stiamo facendo nel
Università della California, ma di più
importantemente dobbiamo capire come
ricevi questi dati da te perché sai
se stai andando meglio oltre il tuo
indagini su se ti piace sono care
o come la struttura del parcheggio al nostro
strutture sono in realtà facendo meglio
dobbiamo fare meglio di questo
e possiamo fare meglio di questo
in realtà costruire questi sistemi e
in realtà inizia a sfruttare i tuoi modi
può comunicare elettronicamente con noi
per darci i dati di cui abbiamo bisogno ora che abbiamo
tutti questi dati e abbiamo speso miliardi a
acquisirla ma come faremo a ottenere
questo per gli scienziati e gli analisti e
ingegneri del software che sanno cosa fare
con questi dati
in modo sicuro e rispettoso è tuo
dati della cartella clinica che dobbiamo
de-identificare quei dati e per me è
davvero importante per me insegnarti
cosa significa de-identificare un
dati della cartella clinica l’ identificazione
non è qualcosa che possiamo inventare è
codificato nella legge federale appare in un
esempio della legge federale che dobbiamo
rimuovere 18 diversi tipi di identificatori
da quella cartella clinica che ci fa
sai che ti appartiene per esempio a
in alto è ovvio che dobbiamo rimuovere
il tuo nome dal disco che abbiamo ottenuto
rimuovi le date che ti abbiamo visto e così via
molto di piu
e ti diciamo che stiamo facendo queste cose
e poi dopo averli de-identificati
registri e certificati sono
deidentificato, quindi possiamo ottenere questo
gli ingegneri del software e gli analisti e
gli scienziati per capire cosa c’è
lavorare in medicina e cosa potrebbe essere
eccessivo in medicina e quando noi
combinare tali dati clinici in molecolari
dati e dati indossabili e comportamentali
dati e le tue preferenze quando noi
combinare tutto ciò che forse allora possiamo
personalizzare l’assistenza sanitaria che forniamo
voi e questo è ciò che chiamiamo precisione
medicina la personalizzazione dell’assistenza sanitaria
siamo in grado di consegnare a voi sulla base di tutte
quei dati e non solo da te ma da
l’ intera popolazione con i risultati
per imparare cosa funziona e non funziona
in medicina e applicalo a te ora
Arrivaci, avremo bisogno di costruire
un enorme database di cui avremo bisogno a
molte persone condividono i loro dati in un
modo sicuro identificato e molecolare
dati e dati clinici e il
dati di imaging e quindi darlo a
scienziati e come lo otterremo
c’è una buona strada da percorrere
l’ iniziativa di medicina di precisione e
ora chiamato tutti noi coorte di ricerca
questo è l’obiettivo che il presidente Obama
stabilito anni fa di reclutare un milione
o più volontari forse alcuni di voi a
contribuire alla registrazione dei dati medici e
i tuoi dati molecolari e analisi del sangue e
D identifica che così possiamo imparare cosa
mantiene le persone sane in salute e cosa
possiamo fare per personalizzare per prenderci cura di quelli
che siamo malati, abbiamo una lunga strada da percorrere
costruisci questo ma inizierai a farlo
vedi i sistemi sanitari e i medici che chiedono
per iniziare a partecipare alla ricerca
studi come questo spero che tu inizi
per dire di sì per cosa sto cercando di fare
medicina di precisione nell’università di
California Sto cercando di costruire mappe di mappe
di morte e malattia ora paragonano questo a
Google Maps che ti porta a piacevole
destinazioni in cui sto cercando di capire
come i californiani si ammalano e muoiono
il nostro stato qui è un esempio di a
la mappa fatta da Hannah e J Hannah era una
ricercatrice nel mio laboratorio gestisce la sua
gruppo di ricerca ora in Corea e Jay
ci ha aiutato con le visualizzazioni qui
un esempio di una mappa con la California reale
dati sul cerchio in alto a sinistra che significa
che vediamo pazienti mostrando con
alcolismo e poi se sei arrivato al
in basso a destra un anno dopo li vediamo
stessi pazienti presentandosi con il fegato
malattia o cirrosi epatica e poi se
lì cerniera posteriore a sinistra sono
mostrando un ascesso di fegato e puoi farlo
fai questo zigzag o potresti venire
verso il basso i quadrati significano il
i pazienti morirono di quelle due malattie così
è davvero raro morire di alcolismo
di solito muori di quegli altri due
disturbi che le mappe possono ottenere molto
complicato qui sui pazienti di sinistra
presentarsi a infarto miocardico acuto
quello è un attacco di cuore che puoi morire bene
lontano da quello, ma se si prende il
rotta nord si finisce il prossimo in un anno
con insufficienza cardiaca significa cuore
il muscolo non è abbastanza forte da pompare il
sangue di cui ha bisogno e tu puoi morire di quello
o che porta alla malattia polmonare l’arancione
cerchio e il liquido inizia a eseguire il backup
perché il cuore non può pompare quel sangue
abbastanza veloce e il grande cerchio blu su
il diritto è la setticemia settica che è a
infezione del sangue ora sono un pediatra I
mai veramente visto molti pazienti mostrare
up, ma un attacco di cuore, ma ho sempre
pensavo che se tu avessi un infarto
è il cuore che ti fa dentro
alla fine, ma in realtà è un’infezione
che vince alla fine dopo le tre
anni e se non prendi il nord
percorso è possibile prendere la strada meridionale
e uccidi prima i tuoi reni e poi
finire con la sepsi in quel modo ora che cosa sono
provare a fare è costruire queste mappe ora
Amo Google Maps uso Google Maps tutto
il tempo ma sono ancora una cosa
Google Maps non può fare Google Maps non può
mostrarti dove sono tutte le macchine
mappa so che ti mostra il traffico
ma non mostra ogni
piccola macchina sulla mappa come potrebbe mai
fallo bene ma per me è la mia visione
l’Università della California non è solo
per costruire le mappe e mostrare le mappe I
in realtà voglio vedere ciò che tutti i nostri 15
milioni di pazienti stanno facendo sulla mappa
dove sono dove stanno andando dopo
questo è un prototipo con la vera California
dati che puoi vedere mentre i pazienti stanno ricevendo
più vecchio stiamo rendendo i colori più brillanti
l’età sale in alto a destra a
molti di loro stanno cercando di ottenere malattie
e tingi un sacco di quello che sto per fare
colpire quel cerchio viola sepsi in a
momento poi moriranno lì loro
andare e possiamo iniziare a usare questa mappa
possiamo iniziare a prevedere cosa c’è
succederà dopo quello che succederà
i prossimi 90 giorni cosa succederà
l’ anno prossimo e cosa faremo
ne
e che per me sta per essere il nuovo
definizione per medicina di precisione come
possiamo effettivamente usare tutto ciò che è molecolare
dati di preferenza del comportamento clinico a
consegnare in modo accurato e responsabile
cura di precisione per i nostri 15 milioni
pazienti nella University California e
questo è ciò che stiamo cercando di costruire questo
è il futuro, quindi siamo circondati da
dati e medicine ma i dati non funzionano
tutto da solo è bloccato è
congelato in questi stagni e pozzanghere lì
sei una pozzanghera per immergerti in quelle
le pozzanghere imparano cosa c’è nella tua medicina
registra i dati e inizia a condividere il tuo
dati delle cartelle cliniche con scienziati e
ricercatori in queste grandi ricerche
coorti abbiamo bisogno dell’aiuto di tutti per costruire
questo nuovo futuro una medicina di precisione
grazie
tu
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